El Consejo Nacional de Evaluación y Acreditación de la Educación Superior (Conea) realizó una evaluación de las universidades del Ecuador. Las ubicó en cinco categorías, siendo las de categoría A las de mejor calidad y nivel académico, en la última categoría (E) están las de más bajo nivel y están en peligro de ser cerradas.
Universidades Categoría A
1. Escuela Politécnica Nacional
2. Escuela Superior Politécnica del Litoral
3. Escuela Politécnica del Ejército
4. Escuela Superior Politécnica del Chimborazo
5. Pontificia Universidad Católica de Quito
6. Universidad Central del Ecuador
7. Universidad de Cuenca
8. Universidad del Azuay
9. Universidad San Francisco de Quito
10. Universidad Técnica de Ambato
11. Universidad Técnica Particular de Loja
Universidades Categoría B
1. Universidad Agraria del Ecuador
2. Universidad de Especialidades Espíritu Santo
3. Universidad de Guayaquil
4. Universidad de las Américas
5. Universidad Estatal de Bolívar
6. Universidad Nacional de Chimborazo
7. Universidad Nacional de Loja
8. Universidad Politécnica Salesiana
9. Universidad Técnica del Norte
Universidades Categoría C
1. Escuela Politécnica Agropecuaria
2. Universidad Católica de Cuenca
3. Universidad Católica de Santiago de Guayaquil
4. Universidad Estatal de Milagro
5. Universidad Estatal del Sur de Manabí
6. Universidad Internacional del Ecuador
7. Universidad Laica Eloy Alfaro de Manabí
8. Universidad Naval Morán Valverde
9. Universidad Técnica de Cotopaxi
10. Universidad Técnica de Machala
11. Universidad Técnica Estatal de Quevedo
12. Universidad Técnica Luis Vargas Torres
13. Universidad Tecnológica Equinoccial
Universidades Categoría D
1. Universidad Casa Grande
2. Universidad De Los Hemisferios
3. Universidad Estatal Amazónica
4. Universidad Internacional SEK
5. Universidad Laica Vicente Rocafuerte
6. Universidad Regional de Los Andes
7. Universidad Técnica de Babahoyo
8. Universidad Técnica de Manabí
9. Universidad Tecnológica Ecotec
Universidades Categoría E
1. Escuela Politécnica Amazónica
2. Escuela Politécnica Prof. Montero
3. Escuela Politécnica Javeriana
4. Universidad Alfredo Pérez Guerrero
5. Universidad Autónoma de Quito
6. Universidad Cristiana Latinoamericana
7. Universidad De Especialidades Turísticas
8. Universidad De Otavalo
9. Universidad Del Pacífico
10. Universidad Estatal de Santa Elena
11. Universidad Iberoamericana del Ecuador
12. Universidad Intercontinental
13. Universidad Interamericana del Ecuador
14. Universidad Intercultural
15. Universidad Metropolitana
16. Universidad Og Mandino
17. Universidad Panamericana de Cuenca
18. Universidad Politécnica Estatal de Carchi
19. Universidad San Antonio de Machala
20. Universidad San Gregorio de Portoviejo
21. Universidad Técnica José Peralta
22. Universidad Tecnológica América
23. Universidad Tecnológica Empresarial
24. Universidad Tecnológica Indoamérica
25. Universidad Tecnológica Israel
26. Universitas Equatorialis
